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信息首页 | 肌病组全新数据库系统使用教程
数据库新系统历经1个月的初步开发上新档案（扫描pdf检索）、文档（知识分享）、云盘（资料分享）、Office（pdf Form填写）、内网PACS（影像系统）、内网slides（数字切片）五大板块，促进组内的信息互通，以下为新的信息系统的注册教学以及各应用功能的介绍。authentik可以登陆档案与文档，内网系统可以登陆PACS和数字切片。
注册
authentik统一登录是新系统的一站式身份验证工具，类似复旦的UIS，采用 SSO的权限控制协议关联不同的应用。
Authentik账号注册
Name (姓名) 部分请使用自己的真实姓名
输入用户、姓名、邮箱、密码后会收到来自我们的企业微信邮箱admin@huashanmuscle.com的验证邮件，需要验证邮箱后才能正式访问，密码找回也是同理用邮箱找回
Authentik权限管理
管理界面可以看到所有人的每条详细访问记录，对不同账号用更精确的权限管理控制访问
文档
肌病组文档共享类似腾讯文档，此站点是为了更好的控制信息安全与版本控制，任何一个lab都有自己的实验protocal，促进分享和交流才能更好互相良好发展。注册authetik后，本应用会自动开通编辑权限，所有人都可以写protocal和批注评论。
采用电子书柜的形式，所有的文章分为书籍→章节→页面的层级架构
文章有浏览大纲、版本控制，批注功能，支持上传附件
档案
- 肌病组档案柜是智能的PDF、WORD、PPT、图片智能检索平台，目前内置了TMGS和DMPK两个不同队列的电子文档档案.
- 需要先用authetik登录一次，首次注册后无法直接访问，需要等管理员（衷画画/仲爽）审批后才能访问
- 即将会把MG的所有扫描评估表、检查报告迁移到这个平台
云盘
请使用单点登录的authentik账号登进云盘。云盘没有部署在服务器而是部署在群晖上，首次登录可能比较慢一点。群晖储存空间有限，目前云盘不作为个人使用。
OnlyOffice支持
OnlyOffice主要用于PDF CRF表的在线填写，可以下载PC或者手机的onlyoffice客户端后通过我们的网盘链接编辑线上的文件
内网
重要数据采用虚拟内网的架构访问，仅绑定设备，只有安装了zerotier客户端的设备在恰当设置、且管理员（金磊）授权后才能访问。
zerotier的工作原理
zerotier客户端类似VPN，但是不会接管整个网络，仅接管对我们服务器的特定ip访问，建议伴随开机启动。为了确保隐私安全，我们没有采用zerotier官方的服务器，全部网络流量走的是我们自己的阿里云网络主机（所以需要替换planet文件）。
- zerotier客户端安装请参考这个文档[客户端配置]，支持Windows、Linux 、MacOS、Android全平台的访问，以下仅列出windows的步骤，其他系统类似。
Windows配置
1. 安装zerotier客户端，替换服务器planet配置
- 首先去zerotier官网下载一个zerotier客户端
- 将上面的
planet.txt文件下载后重命名为planet覆盖粘贴到资源管理器的地址栏C:\ProgramData\ZeroTier\One中(这个目录是个隐藏目录，需要运允许查看隐藏目录才行)
- 重启zerotier服务
- Win+S 搜索
服务，找到ZeroTier One，并且重启服务
- 命令行加入虚拟内网
- 使用管理员身份打开PowerShell，执行如下命令，看到join ok字样就成功了
- zerotier配置好后联系管理员（金磊）授权设备访问
Android设备配置
- 下载ZerotierFix，按照下图设置
Mac设备配置
- 下载planet文件，重命名
planet.txt为planet，进入/Library/Application\ Support/ZeroTier/One/目录，并替换目录下的planet文件
- 切换到root账户
sudo -i，重启 ZeroTier-One：cat /Library/Application\ Support/ZeroTier/One/zerotier-one.pid | sudo xargs kill，再运行zerotier-cli peers检验有无连上服务器
- 加入网络
zerotier-cli join网络id，如上
- 等待管理后台同意加入请求
内网 troubleshooting
有时候切换wifi后，内网出现无法连上的情况。 解决办法：重启Zerotier服务（Service→Zerotier→Stop→start）
内网PACS
肌病组内部影像系统，加入内网后可以直接访问，内存有MRI/CT的原始dicom文件，无需登录可以直接查看
内网Slides
内网数字切片浏览系统cytomine，存有不同格式的Whole slide image，因为是非商业版本功能有限制，不支持接入authentik登录，所以需要先找管理员开通访问账号（请发送Username，Email，password给金磊）。因为目前Olympus VS200的vsi格式不支持直接预览，所以需要用qupath批量转换格式后才能上传我们的全扫切片。
- Preview账号（仅可以访问公共数据库的切片）：User: test, Password: testtest
信息首页
信息首页采用自动发布的工作流程，华山罕见病公众号的草稿在里面自动排版后可以贴到公众号，信息首页也会自己抓取notion里面的内容。所以需要在huashanmuscle.com发表文章的话可以找衷画画开通notion编辑页面的权限，华山罕见病公众号的草稿也可以复制这个模板，然后notion编辑好发我。
华山罕见病 通讯稿 编辑模板
- 复制模板，直接在里面编辑，然后分享给 衷画画 页面链接就行
微信公众号的自动排版
华山罕见病公众号的排版目前采用NotionNice插件，自动生成统一风格的文章，复制到公众号发布
信息首页的文章发布
当前网站的主控面板，除了公众号的文章之外，其他的notion文章写完后把status转换为
pulished 之后，文章会自动被网站抓取
- 作者:华山肌病组
- 链接:http://huashanmuscle.com//article/tutorial
- 声明:本文采用 CC BY-NC-SA 4.0 许可协议，转载请注明出处。